Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD1P11586 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFD1P11586 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms