Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFLP07196 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFLP07196 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFLP07196 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFLP07196 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFLP07196 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFLP07196 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFLP07196 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFLP07196 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFLP07196 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFLP07196 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFLP07196 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFLP07196 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFLP07196 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFLP07196 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFLP07196 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFLP07196 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFLP07196 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFLP07196 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFLP07196 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFLP07196 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NEFLP07196 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFLP07196 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFLP07196 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFLP07196 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFLP07196 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFLP07196 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFLP07196 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFLP07196 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFLP07196 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFLP07196 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFLP07196 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFLP07196 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFLP07196 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFLP07196 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFLP07196 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFLP07196 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFLP07196 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFLP07196 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFLP07196 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFLP07196 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFLP07196 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFLP07196 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFLP07196 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFLP07196 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFLP07196 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFLP07196 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFLP07196 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFLP07196 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFLP07196 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFLP07196 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFLP07196 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFLP07196 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFLP07196 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFLP07196 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFLP07196 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFLP07196 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFLP07196 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFLP07196 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFLP07196 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFLP07196 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEFLP07196 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEFLP07196 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEFLP07196 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEFLP07196 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms