Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCBP05771 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms