Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB6O95452 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB6O95452 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB6O95452 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB6O95452 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB6O95452 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB6O95452 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB6O95452 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB6O95452 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB6O95452 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB6O95452 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB6O95452 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB6O95452 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB6O95452 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB6O95452 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB6O95452 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB6O95452 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB6O95452 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB6O95452 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB6O95452 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB6O95452 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB6O95452 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB6O95452 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB6O95452 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB6O95452 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB6O95452 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB6O95452 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB6O95452 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB6O95452 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB6O95452 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB6O95452 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB6O95452 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB6O95452 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB6O95452 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB6O95452 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB6O95452 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB6O95452 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB6O95452 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB6O95452 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB6O95452 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB6O95452 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB6O95452 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB6O95452 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB6O95452 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB6O95452 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB6O95452 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB6O95452 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB6O95452 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB6O95452 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB6O95452 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB6O95452 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB6O95452 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB6O95452 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB6O95452 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB6O95452 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB6O95452 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB6O95452 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB6O95452 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB6O95452 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB6O95452 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB6O95452 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB6O95452 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB6O95452 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB6O95452 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB6O95452 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB6O95452 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB6O95452 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB6O95452 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB6O95452 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB6O95452 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB6O95452 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB6O95452 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB6O95452 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB6O95452 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB6O95452 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB6O95452 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB6O95452 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB6O95452 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB6O95452 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB6O95452 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB6O95452 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB6O95452 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB6O95452 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB6O95452 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB6O95452 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms