Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL3O95236 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL3O95236 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL3O95236 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL3O95236 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL3O95236 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL3O95236 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL3O95236 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL3O95236 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL3O95236 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL3O95236 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL3O95236 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL3O95236 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL3O95236 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL3O95236 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL3O95236 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL3O95236 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL3O95236 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL3O95236 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms