Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40AO75400 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms