Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM4AO75164 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM4AO75164 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM4AO75164 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms