Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN1O60635 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN1O60635 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN1O60635 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms