Protein–RNA interactions for Protein: O60462

NRP2, Neuropilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRP2O60462 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRP2O60462 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRP2O60462 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NRP2O60462 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRP2O60462 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRP2O60462 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRP2O60462 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRP2O60462 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRP2O60462 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRP2O60462 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRP2O60462 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRP2O60462 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRP2O60462 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRP2O60462 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRP2O60462 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRP2O60462 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRP2O60462 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRP2O60462 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NRP2O60462 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRP2O60462 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRP2O60462 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRP2O60462 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRP2O60462 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRP2O60462 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRP2O60462 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRP2O60462 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRP2O60462 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRP2O60462 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NRP2O60462 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRP2O60462 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NRP2O60462 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRP2O60462 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRP2O60462 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NRP2O60462 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRP2O60462 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRP2O60462 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRP2O60462 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRP2O60462 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRP2O60462 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRP2O60462 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRP2O60462 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRP2O60462 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRP2O60462 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRP2O60462 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRP2O60462 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRP2O60462 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRP2O60462 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRP2O60462 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRP2O60462 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRP2O60462 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRP2O60462 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NRP2O60462 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRP2O60462 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRP2O60462 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRP2O60462 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRP2O60462 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRP2O60462 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRP2O60462 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRP2O60462 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRP2O60462 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRP2O60462 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms