Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC11O43248 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms