Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3KRW8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3KRW8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3KRW8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3KRW8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3KRW8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3KRW8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KRW8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KRW8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KRW8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KRW8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KRW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KRW8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KRW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KRW8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KRW8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KRW8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KRW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KRW8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KRW8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
J3KRW8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KRW8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KRW8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KRW8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KRW8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KRW8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KRW8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KRW8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KRW8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KRW8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KRW8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KRW8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3KRW8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KRW8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3KRW8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms