Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms