Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVD1

FAM237B, Family with sequence similarity 237 member B, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM237BA0A1B0GVD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM237BA0A1B0GVD1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms