Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHB6Q9Y5E3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB6Q9Y5E3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms