Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COG6Q9Y2V7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms