Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8A1Q9Y2Q0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8A1Q9Y2Q0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.3 ms