Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF6Q9Y252 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF6Q9Y252 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF6Q9Y252 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF6Q9Y252 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF6Q9Y252 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF6Q9Y252 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF6Q9Y252 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF6Q9Y252 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF6Q9Y252 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF6Q9Y252 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF6Q9Y252 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms