Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFRSF19Q9NS68 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF19Q9NS68 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.3 ms