Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms