Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX6-2Q9C056 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX6-2Q9C056 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms