Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL1Q99961 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms