Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NMD3Q96D46 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms