Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM139Q8IV31 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms