Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIOX2Q8IUF8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOX2Q8IUF8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOX2Q8IUF8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms