Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV9

HPS6, Hermansky-Pudlak syndrome 6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6Q86YV9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS6Q86YV9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS6Q86YV9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS6Q86YV9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS6Q86YV9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS6Q86YV9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS6Q86YV9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS6Q86YV9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS6Q86YV9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS6Q86YV9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms