Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SKAP1Q86WV1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKAP1Q86WV1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms