Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP30Q70CQ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP30Q70CQ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms