Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACAD11Q709F0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACAD11Q709F0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms