Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3W7

SCYL2, SCY1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL2Q6P3W7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCYL2Q6P3W7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCYL2Q6P3W7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms