Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms