Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms