Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9B1Q4ZJI4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms