Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms