Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RIPK1Q13546 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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