Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YPL073CYPL073C 486 nt4.86□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 SDA1YGR245C 2304 nt4.86□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 OMS1YDR316W 1416 nt4.86□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 BUD22YMR014W 1560 nt4.86□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YDR222WYDR222W 1248 nt4.85□□□□□ -1.63 RIP-Chip
PUF2Q12221 TCA17YEL048C 459 nt4.85□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 NVJ1YHR195W 966 nt4.85□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt4.85□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YNL143CYNL143C 393 nt4.85□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YIF1YNL263C 945 nt4.85□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 HRT1YOL133W 366 nt4.85□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 KAR1YNL188W 1302 nt4.85□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 FKH1YIL131C 1455 nt4.85□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 GSH2YOL049W 1476 nt4.85□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 PRM1YNL279W 1986 nt4.85□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 PSE1YMR308C 3270 nt4.85□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 UBP7YIL156W 3216 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 MGS1YNL218W 1764 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 SIS2YKR072C 1689 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 MAL13YGR288W 1422 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 GRX6YDL010W 696 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 HSP31YDR533C 714 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 RPL28YGL103W 450 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YGR153WYGR153W 654 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 RSF1YMR030W 1131 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 MTG1YMR097C 1104 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 ATG14YBR128C 1035 nt4.84□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 CKS1YBR135W 453 nt4.84□□□□□ -1.63 RIP-Chip
PUF2Q12221 GCN20YFR009W 2259 nt4.84□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 UBX7YBR273C 1311 nt4.83□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 MHF2YDL160C-A 243 nt4.83□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 PFA5YDR459C 1125 nt4.83□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 ECM1YAL059W 639 nt4.83□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YLR124WYLR124W 345 nt4.83□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 CTL1YMR180C 963 nt4.83□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YIP3YNL044W 531 nt4.83□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 CBP1YJL209W 1965 nt4.83□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 RRP3YHR065C 1506 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 TUP1YCR084C 2142 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 AFT1YGL071W 2073 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 PUT1YLR142W 1431 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 SWI3YJL176C 2478 nt4.82□□□□□ -1.64 RIP-Chip
PUF2Q12221 GCV1YDR019C 1203 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 SCS2YER120W 735 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 MRF1YGL143C 1242 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YGR283CYGR283C 1026 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YJL220WYJL220W 453 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 NMA1YLR328W 1206 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 RPP0YLR340W 939 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 BLS1YLR408C 369 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 MET3YJR010W 1536 nt4.82□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 CMK1YFR014C 1341 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 AAD4YDL243C 990 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 GRE3YHR104W 984 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 UIP3YAR027W 708 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 ATG19YOL082W 1248 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 DCP1YOL149W 696 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 PEX27YOR193W 1131 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 TAZ1YPR140W 1146 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 MGR3YMR115W 1506 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 IXR1YKL032C 1794 nt4.81□□□□□ -1.64 RIP-Chip
PUF2Q12221 WTM2YOR229W 1404 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 SMP1YBR182C 1359 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 MRPL6YHR147C 645 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 SPO16YHR153C 597 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 SLZ1YNL196C 897 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 RCL1YOL010W 1104 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YOL107WYOL107W 1029 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 DCI1YOR180C 816 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 SUI3YPL237W 858 nt4.8□□□□□ -1.64 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBR089WYBR089W 600 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 STE20YHL007C 2820 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YDL026WYDL026W 312 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YDL183CYDL183C 963 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YDR249CYDR249C 1122 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 NSE3YDR288W 912 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YDR336WYDR336W 945 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 MOB2YFL034C-B 864 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YGR273CYGR273C 525 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 RPS31YLR167W 459 nt4.79□□□□□ -1.64 RIP-Chip
PUF2Q12221 CDA2YLR308W 939 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 BTS1YPL069C 1008 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 FUM1YPL262W 1467 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 SNF3YDL194W 2655 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 RAD30YDR419W 1899 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 RMD1YDL001W 1293 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 ARD1YHR013C 717 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 WSS1YHR134W 810 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 SAW1YAL027W 786 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 CCS1YMR038C 750 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 PRO2YOR323C 1371 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF2Q12221 SUP35YDR172W 2058 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 APC4YDR118W 1959 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF2Q12221 SIF2YBR103W 1608 nt4.77□□□□□ -1.65
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