Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CGNL1Q0VF96 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CGNL1Q0VF96 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms