Protein–RNA interactions for Protein: Q09MP3

RAD51AP2, RAD51-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51AP2Q09MP3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51AP2Q09MP3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51AP2Q09MP3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms