Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP3Q02447 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP3Q02447 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SP3Q02447 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP3Q02447 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP3Q02447 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP3Q02447 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SP3Q02447 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP3Q02447 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP3Q02447 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SP3Q02447 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP3Q02447 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP3Q02447 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP3Q02447 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP3Q02447 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP3Q02447 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP3Q02447 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP3Q02447 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP3Q02447 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SP3Q02447 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP3Q02447 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP3Q02447 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP3Q02447 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SP3Q02447 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SP3Q02447 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP3Q02447 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP3Q02447 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP3Q02447 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP3Q02447 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP3Q02447 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP3Q02447 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP3Q02447 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP3Q02447 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP3Q02447 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP3Q02447 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP3Q02447 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP3Q02447 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP3Q02447 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP3Q02447 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP3Q02447 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP3Q02447 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP3Q02447 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SP3Q02447 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP3Q02447 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP3Q02447 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP3Q02447 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP3Q02447 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP3Q02447 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SP3Q02447 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SP3Q02447 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP3Q02447 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP3Q02447 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms