Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APBA1Q02410 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA1Q02410 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms