Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU5F1Q01860 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POU5F1Q01860 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms