Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms