Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGGT1BP53609 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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