Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms