Protein–RNA interactions for Protein: P49593

PPM1F, Protein phosphatase 1F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1FP49593 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1FP49593 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1FP49593 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms