Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCP4P48539 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4P48539 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4P48539 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4P48539 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4P48539 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4P48539 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4P48539 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4P48539 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4P48539 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4P48539 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4P48539 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4P48539 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4P48539 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4P48539 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4P48539 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4P48539 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4P48539 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 318.7 ms