Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 348.7 ms