Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms