Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA3P42263 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms