Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNFP41002 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNFP41002 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNFP41002 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNFP41002 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNFP41002 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNFP41002 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNFP41002 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNFP41002 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNFP41002 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNFP41002 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNFP41002 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNFP41002 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNFP41002 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNFP41002 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNFP41002 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNFP41002 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNFP41002 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNFP41002 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNFP41002 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNFP41002 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNFP41002 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNFP41002 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNFP41002 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNFP41002 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNFP41002 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNFP41002 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNFP41002 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNFP41002 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNFP41002 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNFP41002 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNFP41002 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNFP41002 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNFP41002 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNFP41002 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNFP41002 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNFP41002 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNFP41002 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNFP41002 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNFP41002 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNFP41002 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNFP41002 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNFP41002 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNFP41002 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNFP41002 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNFP41002 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNFP41002 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNFP41002 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNFP41002 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNFP41002 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNFP41002 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNFP41002 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNFP41002 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNFP41002 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNFP41002 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms