Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH5P33151 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH5P33151 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH5P33151 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH5P33151 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH5P33151 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH5P33151 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH5P33151 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH5P33151 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH5P33151 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH5P33151 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH5P33151 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH5P33151 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH5P33151 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH5P33151 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH5P33151 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH5P33151 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH5P33151 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH5P33151 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH5P33151 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH5P33151 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH5P33151 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH5P33151 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH5P33151 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH5P33151 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH5P33151 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH5P33151 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH5P33151 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH5P33151 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH5P33151 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH5P33151 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH5P33151 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH5P33151 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH5P33151 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDH5P33151 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDH5P33151 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDH5P33151 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH5P33151 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH5P33151 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH5P33151 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH5P33151 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH5P33151 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH5P33151 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH5P33151 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH5P33151 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH5P33151 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH5P33151 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH5P33151 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH5P33151 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH5P33151 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH5P33151 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH5P33151 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH5P33151 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH5P33151 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH5P33151 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH5P33151 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH5P33151 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH5P33151 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH5P33151 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms